《狄仁杰之运河惊龙》以垂拱元年武则天夜巡大运河为开端。洛阳万人空巷，百姓奔赴龙门争睹圣容，不料龙船在运河中遭遇龙形异兽猛烈冲撞，朝野震动。百姓议论纷纷，皆称此乃不祥之兆，武则天大怒，急召狄仁杰回宫彻查运河龙王一案。狄仁杰奉命重返洛阳，发现案件远比“异兽作乱”复杂。运河沿岸漕运帮派、地方官吏与朝中权贵暗中勾结，借龙王传说掩盖不可告人的勾当。所谓龙形异兽，实为有人精心设计的机关与伪装，目的是制造恐慌、动摇圣心，甚至伺机行刺武则天。随着调查深入，狄仁杰与助手们潜入运河暗道，探访龙门险滩，逐步揭开一个涉及巨额漕银与皇权争斗的惊天阴谋。真凶利用水势、机关和民间信仰布下重重迷局，企图将罪责推给无辜百姓。狄仁杰凭借缜密推理与过人胆识，在龙门对决中拆穿骗局，擒获幕后主使，还运河安宁，也还天下一个真相。